Minggu, 24 Januari 2021

Mengenal RNA Polimerase IV & V

      Selama ini kita hanya mengetahui 3 jenis RNA  polimerase kan, ada RNA Pol I, RNA Pol II dan RNA Pol III dan tentu sudah kita ketahui bersama tentang struktur letak dan fungsinya dalam mekanisme ekspresi gen pada eukariotik. Nah ada RNA Pol IV & V loh yang ada pada tumbuhan. mungkin baru dengar yah. tapi RNA Pol IV & V ini selain bisa dibaca pada artikel diatas juga ada pada buku "Non Coding RNAs in Plants yang ditulis oleh Volker A. Erdmann & Jan Barciszewski halaman 421 dst".

             Pol IV dan Pol V, yang memainkan peran penting dalam jalur pembungkaman gen yang dimediasi RNA (Katshiko S, etc. 2014. Nucleic Acid Polymerase. USA: Springer hal: 5). 


        Proses purifikasi afinitas yang dilakukan pada pol IV dan Pol V pada arabidopsis thaliana, kembang kol, dan jagung menunjukkan perbedaan yang signifikan pada komposisinya terutama pada subunit subunitnya. ("RNA Pol IV and V in Gene Silencing: Rebel Polymerases Evolving Away From Pol II’s Rules" )
        Selain itu ditemukan juga ada yang mirip dari 12 subunit pada Pol IV & V dengan 12 subunit pada Pol II. Beberapa subunit Pol IV dan Pol V dikodekan oleh gen yang sama dengan subunit Pol II yang sesuai, tetapi yang lain berasal dari duplikasi gen subunit Pol II yang telah berubah seiring waktu. Secara keseluruhan, empat subunit Pol IV berbeda dengan Pol II, enam subunit Pol IV berbeda dengan Pol II, dan empat subunit berbeda antara Pol IV dan Pol V. Namun, semua subunit Pol IV dan Pol V adalah "apel yang belum jatuh jauh dari pohon Pol II". (https://source.wustl.edu/2009/01/plant-polymerases-iv-and-v-are-special-forms-of-polymerase-ii/).
        Meskipun telah berevolusi dari Pol II, Pol IV dan V tampaknya tidak terlibat dalam sintesis protein, atau sangat penting bagi kehidupan. Sebaliknya, mereka telah mengambil peran khusus dalam pembungkaman gen pada tumbuhan. Hal ini penting untuk mencegah ekspresi gen yang berpotensi membahayakan, seperti "gen pelompat" yang diturunkan dari virus yang dikenal sebagai retrotransposon, dan asam nukleat yang menyerang, seperti genom virus yang mereplikasi. Laboratorium Pikaard telah menunjukkan bahwa Pol IV diperlukan untuk produksi small interfering RNAs (disingkat siRNA) yang menentukan pembungkaman urutan DNA yang kompelementer, sedangkan Pol V membuat RNA yang lebih panjang yang diperkirakan berpasangan dengan siRNA di situs kromosom yang terpengaruh.(https://source.wustl.edu/2009/01/plant-polymerases-iv-and-v-are-special-forms-of-polymerase-ii/).

Latest
Next Post

0 Comments: